針對大腸桿菌病的嚴重危害，科技工作者和廣大養殖人員研究采取了一系列防制措施，取得了很好的效果。如應用抗生素進行治療，運用滅活苗、微生態類制品、基因工程技術和抗菌類藥物等進行預防，提高飼養水平和抗應激能力等等。
但是人們忽略了一個重要的問題，這就是：致病性大腸桿菌為自然環境中的常在菌，它的血清型甚多，重復感染的機會也多，與其它傳染病合并感染的頻率極高。因此疫病的綜合性防制和營造良好的飼養環境就成為了養雞業控制大腸桿菌病的關鍵所在。我們僅從飲水、飼料和雞舍這三個方面就輕而易舉地說明道理：飲水極易腐敗變質，通常養雞場使用的是貯水式給水器和罐式飲水器，在混入的飼料、塵埃和雞的唾液等污物的污染下，通常一晝夜細菌會增殖百萬倍，尤其是夏季和雞舍內溫度較高的情況下，以及在飲水中添加營養性物質（如維生素等）。在飼料中反映出的問題更為嚴重，本來大腸桿菌對抗生素類藥品就有較強的抗藥性，但現在的一些飼料生產企業濫加抗生素，使病原微生物產生的抗藥性給預防和治療都帶來極大的困難。另外，飼料廠在生產中原材料品質較差，劣質的原料（魚粉、骨粉、羽毛粉、血粉等）帶入大量的致病菌。 雞舍的環境衛生不好，就可給大腸桿菌的繁衍創造更加良好的條件。在這種情況下諸如濕度、溫度、灰塵、酸堿度發生改變時，當飼養水平低下時病雞就會源源不斷地出現。
那么針對上述原因引起的大腸桿菌病我們應采取如何的對策呢？肯定地說最好的辦法就是消毒！消毒工作在所有的養殖單位都有著與免疫接種和其它防疫措施異曲同工的作用。但它往往不被人們所重視，尤其是施行傳統養殖習慣的養雞戶常常抱僥幸心理或嫌麻煩。我們說消毒的重要目的有二：其一是通過消毒創造一個沒有致病微生物生存和繁殖的良好的養殖環境。其二是殺滅和抑制已經產生的致病微生物，減少其對動物的感染機會。
消毒時需要注意 ：
1、雞舍、飲水、飼料和雞群消毒的藥品，必須是安全、無味、無刺激性的。
2、嚴格按照說明書使用，按規定的比例進行稀釋。
3、冬季至少每周消毒一次，夏季每周兩次以上，有病雞發生時要適當增加消毒次數。
4、雞舍和雞群要準備兩種以上不同種類的消毒劑（不是同種類的兩種商品）。